研究環境

ラボスペース

ラボ図面

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

解析機器
脳定位手術固定器
Ultrasonic Vocalization 超音波音声測定器
クライオスタット 組織切片作成
リニアスライサー 臓器スライス作成
Bioruptor 超音波破砕機
EVOS FL 蛍光顕微鏡
キーエンスBZ-X 蛍光顕微鏡
iBright 分子イメージング機
QuantStudio リアルタイムPCR機
AKTAフラクションコレクター, コールドルーム

共用機器
 成育医療センターは共同研究管理室がとても上手く機能していて共通機器がハイレベルで維持されているのが強みです!!
Olympus FV3000 共焦点タイムラプス
DeltaVision 高解像度顕微鏡
AriaIII セルソーター
NextSeq550 高速シーケンサー
Digatal PCR
Nanopore P2 Solo ロングリード・シーケンサー
解析サーバー
Tape Station
Bioanalyzer
Flux Analyzer
モデル生物施設

 

解析ウェブツール
研究にかかせない便利な解析ツールやデータベースです。開発者の皆様ありがとうございます。

Gene expression analyses
Seurat
scRNA-tools
computer programmingMonocle3
Garnett
MISO
ChIP-Atlas 結果が美しく示されそのまま論文に使えるすごいウェブ解析サイト
JASPAR 転写モチーフのデータベース

Primer synthesis
Dr.Kazu.com
Ensembl
Primer3
UCSC Genome Browser
Nucleotide BLAST
NCBI Gene

Gene and animal information
NCBI Gene
Refseq BLAST
GeneCards
Mouse Genome Informatics
IMPC

Protein analysisalpha_fold
CLUSTALW
Expasy Translate
UniProt
PrDOS
AlphaFold

Expression database
Allen Brain Atlas
Protein Atlas
BICCN
Human Cell Atlas

Metabolome analysis
MetaboAnalyst

GGdb

Plasmid distributers
Riken BRC

Kazusa DNA Res Inst
Addgene

Experiment tool download
ApE, A plasmid Editor
Fiji
PyMol
Loupe Browser
R
RStudio

Bioinformaticsprogramming
Google Colab
Git
PyCharm
ParaView
Anaconda
ATOM

Human genetics
Polyphen-2
stethoscopeClinVar
gnoMAD
dbSNP
DisGeNET
HGMD
Orphanet
GeneReviews  ヒト遺伝子疾患の包括的データベース